Во время проверки налоговая оценивает не только документы, но и то, была ли хозяйственная операция в действительности.
Если компания не сможет подтвердить, что работы действительно выполнены, товар поставлен или услуги оказаны, налоговая может признать сделку нереальной и отказать в вычете по НДС.
Для защиты вычета обычно недостаточно только счета-фактуры. Важно, чтобы были договор, акты, накладные, платежные документы, деловая переписка и другие доказательства, подтверждающие реальность сделки.